L’association propose la création d’outils pédagogiques qui répondent à des objectifs spécifiques. Il peut à la fois s’agir de mallettes (Roll’Air sur la qualité de l’air, Ressort sur les énergies, EPI sur la biodiversité cultivée…) ou d’outils venant en appui d’un dispositif (poubelle pédagogique sur la prévention déchets pour Montpellier Méditerranée Métropole, jeu de la Propreté pour MMM).
Le CPIE APIEU coordonne plusieurs programmes en sciences participatives. Chaque année des centaines de bénévoles partagent leurs observations et améliorent ainsi la connaissance des espèces, des milieux et des menaces.